核糖體RNA

核糖體RNA（ribosomal RNA, rRNA）是生物體中核糖核酸（RNA）的一類，為核糖體（ribosome）的主要部份，功能為提供一個環境能使tRNA對應到mRNA上的密碼子，而合成蛋白質。其中核糖體大亞基（large subunit, LSU）具有一或兩個rRNA分子（多數原核生物爲23S和5S，真核生物爲28S和5.8S），小亞基（small subunit, SSU）具有一个rRNA分子（多數原核生物爲16S，真核生物爲18S）。

在近年的系統發育樹中，核糖體RNA序列，尤其是小亞基RNA（SSU rRNA）成爲最常用的做樹依據，因爲SSU rRNA具有以下特點：

• 長度適中，通常1200～1900bp，能夠提供足夠的信息，但又不過長。
• 完全廣泛分佈于所有生物，而且具有相對緩慢的進化過程。其中保守區可用於構建所有生命的大一統進化樹，而易變的區域可用來區別屬或者種。
• 所有的rRNA都是功能上和序列上同源的，且一個生物細胞中的rRNA序列完全一致或極少差別（除葉綠體和線粒體等和極少數例外情況）。
• rRNA基因的水平轉移非常難發生，因爲它們的功能太基本且重要，需要翻譯機制的精細調控才能夠正常實現功能。